Neste laboratório estão armazenadas as cepas microbianas do banco de culturas utilizadas pelo grupo de pesquisa em processos biotecnológicos e são realizados os processos fermentativos para produção de bioetanol de segunda geração:

• produção por fermentação sólida e submersa, purificação e concentração de enzimas para a produção de etanol de segunda geração;

• produção de etanol de segunda geração por fermentação submersa utilizando diferentes substratos de biomassa e diferentes cepas para hidrolise de açúcares C₅ e C₆;

• produção de enzimas para álcool de segunda geração empregando cepas do cerrado.

Neste laboratório também se realiza as análises  reológicas e de liofilização.